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Als erste Besonderheit, insbesondere für nicht Smalltalk Programmierer ist das Konzept der Speicherverwaltung in Java zu nennen. In Java gibt es keinen Heap auf dem dynamische Daten allociert werden, also auch kein malloc oder mfree. Vielmehr sorgt die Java Laufzeitumgebung selbst dafür, das nicht mehr benötigte Objekte automatisch freigegeben werden. Dazu trägt jedes Objekt einen Zähler mit sich, wie viele Verweise auf das Objekt noch existieren.
Die Arbeit selbst dafür zu sorgen das Objekte rechtzeitig freigegeben werden, die z.B. in C++ bei komplexeren Programmen extreme Ausmaße annimmt entfällt also völlig. Man spricht von einem Garbage Collector. In Java läuft dieser Garbage Collector in einem eigenen Task mit niederer Priorität, das Aufräumen wird also im Hintergrund erledigt.
Speicherleichen, also Objekte die nicht mehr benötigt werden, deren Speicher jedoch nicht freigegeben wurde gehören automatisch der Vergangenheit an. Es kann auch nicht mehr vorkommen das eine Referenz auf ein nicht mehr allociertes Objekt existiert, was bei C und C++ zu häufigen Fehlern geführt hat (z.B. eine durch eine lokale Funktion deklarierte Variable wird per Pointer dem Aufrufer bekanntgegeben).
Dieses Konzept tritt nicht nur auf Objekte sondern auch für Klassen in Kraft, da Klassen in Java nichts anderes sind als von der Klasse Objekt abgeleitete Objekte. Das heißt insbesondere das zur Laufzeit eines Programms nur die Klassen im Hauptspeicher gehalten werden die auch wirklich gebraucht werden. Das hat zur Folge, daß beim Programmstart zunächst nur die Basisklassen z.B. der awt Library geladen werden, was allerdings auf Grund des dynamischen Linkvorgangs, der gleichzeitig einsetzt merklich Zeit in Anspruch nimmt.
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